Hanadan raconte l'histoire d'une jeune lycéenne de 16 ans provenant d'un milieu modeste, Tsukushi Makino, qui est parvenue à entrer dans le lycée d'Eïtoku, un établissement privé très célèbre, ou on y retrouve les jeunes les plus "friqués" du pays. Très vite, elle va se heurter à une bande de quatre jeune garçons que l'on surnomme le " F4" ( signifiant Flowers Four= les quatre fleurs... mdr). En effet, ces derniers font régner la terreur dans le lycée, en attribuant des « cartons rouges » aux élèves qui ont le malheur de ne pas leur plaire. Cette dernière finira par recevoir ce carton rouge et elle va alors retrouver persécutée. Mais Tsukushi décide de tenir tête et déclare alors la guerre au F4 et particulièrement au chef du groupe, Tsukasa Dômyôji.